黑龍江工程學院總共有45個專業(yè)。

黑龍江工程學院本科專業(yè)有37個：測繪工程、自動化、交通工程、電子信息工程、交通運輸、建筑學、建筑環(huán)境與設(shè)備工程、材料成型及控制工程、材料科學與工程、軟件工程、工業(yè)設(shè)計、道路橋梁與渡河工程、機械設(shè)計制造及其自動化、車輛工程、汽車服務(wù)工程、土木工程、物流工程、城市規(guī)劃、遙感科學與技術(shù)、測控技術(shù)與儀器、機械電子工程、電氣工程及其自動化、國際經(jīng)濟與貿(mào)易、計算機科學與技術(shù)、信息管理與信息系統(tǒng)、空間科學與技術(shù)、會計學、應(yīng)用化學、工程管理、英語、市場營銷、財務(wù)管理、旅游管理、社會工作、地理信息系統(tǒng)、信息與計算科學、材料化學。

黑龍江工程學院其他專業(yè)有8個：給水排水工程、復(fù)合材料與工程、數(shù)字媒體藝術(shù)、生物功能材料、能源工程及自動化、電子科學與技術(shù)、俄語、新媒體與信息網(wǎng)絡(luò)。