四川農業(yè)大學總共有78個專業(yè)。

四川農業(yè)大學本科專業(yè)有70個：制藥工程、食品科學與工程、食品質量與安全、生物醫(yī)學工程、生物工程、藥學、中草藥栽培與鑒定、藥物制劑、計算機科學與技術、農業(yè)機械化及其自動化、環(huán)境工程、農業(yè)電氣化與自動化、農業(yè)建筑環(huán)境與能源工程、森林工程、木材科學與工程、農業(yè)水利工程、植物科學與技術、草業(yè)科學類（中外合作辦學）、財務管理、社會體育、土木工程、野生動物與自然保護區(qū)管理、種子科學與工程、資源環(huán)境與城鄉(xiāng)規(guī)劃管理、園林、人力資源管理、地理信息系統(tǒng)、動物科學、環(huán)境生態(tài)、土建、動物醫(yī)學、旅游管理、生態(tài)學、城市規(guī)劃、水產養(yǎng)殖學、煙草、土地資源管理、農業(yè)資源與環(huán)境、經濟學、農林經濟管理、生物技術、林學、農村區(qū)域發(fā)展、國際經濟與貿易、生物科學、電子商務、水利水電工程、金融學、森林資源保護與游憩、信息管理與信息系統(tǒng)、法學、動植物檢疫、工商管理、社會工作、水土保持與荒漠化防治、教育技術學、環(huán)境科學、市場營銷、信息與計算科學、農學、化學生物學、園藝、植物保護、茶學、草業(yè)科學、應用化學、應用物理學、廣告學、英語、漢語言文學。

四川農業(yè)大學其他專業(yè)有8個：思想政治教育、景觀建筑設計、工程造價、設施農業(yè)科學與工程、應用生物科學、工程管理、政治學與行政學、包裝工程。