二十一世紀是生命科學的世紀，生物、醫(yī)學與工程科學的交叉融合是國際上重大基礎研究成果的機遇所在，是新型醫(yī)療器械和生物醫(yī)藥產業(yè)的原創(chuàng)思想出發(fā)點，也是解決航空航天醫(yī)學工程和空間生命科學關鍵問題的科學技術基礎。
航空航天是我國重點發(fā)展的高科技領域，新型醫(yī)療器械和生物醫(yī)藥產業(yè)是我國重點發(fā)展的戰(zhàn)略性新興產業(yè)。
北航生物與醫(yī)學工程學院自創(chuàng)建以來，經(jīng)短短10年的建設，已成為接軌國際、全國一流的生物醫(yī)學工程領域人才培養(yǎng)單位，獲得了國內外同行的高度認可，生物醫(yī)學工程學科在教育部最新一輪學科評估中排名第六。
學院具有完整的本科、碩士、博士和博士后人才培養(yǎng)體系，擁有生物醫(yī)學工程一級學科博士授權點和博士后流動站、基礎醫(yī)學和特種醫(yī)學兩個一級學科碩士授權點、以及北京市重點交叉學科、北京市特色專業(yè)、國防重點學科、工信部兩化融合類重點學科，入選教育部卓越工程師計劃。
學院承擔了國家各類重要科研項目，科研經(jīng)費充足，已在分子、細胞、組織、器官以及系統(tǒng)等各個層次建立了接軌于國際先進水平的實驗平臺，具有一流的精英式人才培養(yǎng)環(huán)境。
學院先后獲批“生物力學與力生物學”教育部重點實驗室、“康復輔具技術與系統(tǒng)”民政部重點實驗室、“醫(yī)療器械和康復工程”中關村開放實驗室、“高端植介入醫(yī)療器械優(yōu)化設計與評測技術”北京市重點實驗室，“中俄生物技術與醫(yī)學工程北京市國際科技合作基地”、“植介入醫(yī)療器械北京市國際科技合作基地”、“空天生物技術與醫(yī)學工程國際聯(lián)合研究中心”（科技部國家級國際科技合作基地），以及“生物力學與力生物學創(chuàng)新引智基地”（教育部、國家外專局的高等學校學科創(chuàng)新引智計劃）。
學院還與空軍航空醫(yī)學研究所等研究機構，空軍總醫(yī)院、海軍總醫(yī)院等臨床醫(yī)院，以及納通、駝人、誼安等醫(yī)療器械重要企業(yè)簽訂有戰(zhàn)略合作協(xié)議，可為學院學生的實習、就業(yè)提供良好的支撐。
學院有一支結構合理、年輕卓越的高水平師資隊伍。
現(xiàn)任院長樊瑜波教授為中國生物醫(yī)學工程學會理事長、國家醫(yī)療器械創(chuàng)新聯(lián)盟副理事長、世界生物力學理事、IFBE執(zhí)委、AIMBE會士、WACBE候任主席；學院共有專任教師60人，95%以上具有博士學位，85%以上具有海外留學經(jīng)歷；學術帶頭人中包括院士1名、“千人計劃”教授1名，長江學者1名，杰出青年基金獲得者2名，國際宇航科學院空間生命學部院士、通訊院士各1名；科技部創(chuàng)新團隊1個。
學院人才培養(yǎng)的整體定位是：面向生物醫(yī)學工程產業(yè)、新醫(yī)藥產業(yè)、以及航空航天醫(yī)學工程和空間生命科學，培養(yǎng)厚基礎、善創(chuàng)新，具有領軍、領導潛質和國際視野的復合型人才。
學院以生物醫(yī)學工程大類招收本科生，按照通識教育、共同教育、專業(yè)教育、個性化教育四個階段來進行實施人才培養(yǎng)，進入專業(yè)教育階段后，學生可以在十個專業(yè)模塊中選擇最適合自己的方向。
學院實施完全學分制，學生可以根據(jù)自己的學習興趣、能力和進度、以及對未來發(fā)展的規(guī)劃，在培養(yǎng)方案的總體框架下，自主選擇和安排課程。
學院特別強調創(chuàng)新能力和綜合素質的培養(yǎng)，注重學生的個性化發(fā)展，全面實施分階段全員型本科生導師制，所有學生從大一開始就可在導師的指導下在各個方向實驗室從事科研實踐；同時，學院定期開展生物醫(yī)學名家論壇、教育文化講堂、學術沙龍、優(yōu)秀企業(yè)進學院等活動，所有學生均有機會與本領域的世界一流學者、教育大家和優(yōu)秀企業(yè)家進行面對面的深入交流。
學院是北航國際交流最活躍的單位之一，與美國、歐洲、俄羅斯、日本、香港等國家和地區(qū)的國際一流大學、研究機構都有廣泛的實質性合作，已經(jīng)與密歇根大學、哥倫比亞大學、香港中文大學等多個大學簽署了學生交換協(xié)議；目前有25%左右的學生在本科階段被公派到境外進行學習和實習，未來3年內，這個比例將增加到40%。
作為學校的試點改革單位，學院正在實施本研一體化人才培養(yǎng)模式，優(yōu)秀學生可實現(xiàn)本-碩、本-碩-博連讀，也可在完成本科學業(yè)后通過保送、交換等形式在國內外相關研究機構、大學繼續(xù)深造，讀研及出國進修比例在75%以上。
學院本科生連續(xù)三年獲得北航學生最高榮譽“金質獎章”，連續(xù)2屆獲得“馮如杯”一等獎，畢業(yè)生一次就業(yè)率近年來一直保持100%，就業(yè)單位既包括國家食品藥品監(jiān)督管理局、國家海關、北京市醫(yī)療器械檢驗所等政府機關和事業(yè)單位，也包括強生、飛利浦、美敦力、納通等國內外大型企業(yè)，所培養(yǎng)的人才深受這些單位的歡迎。